北京大學深圳醫院生殖醫學科成立于2000年，于2002年通過衛生部人類輔助生殖技術評審，成為當時廣東省三家、深圳市唯一一家首批獲得準入的專科，同年被確定為深圳市重點醫學專科。2003年被評為廣東省特色專科。該科致力于各種生育功能障礙的臨床診治及相關基礎研究，將現代輔助生育技術應用于臨床。

　　北京大學深圳醫院生殖醫學科集醫、教、研為一體，作為北京大學博士后培養工作站、生殖內分泌學博士點及碩士點，同時為汕頭大學醫學院、安徽醫科大學碩士點，為生殖領域培養和輸送了大批專業人才，先后承擔廣東省自然科學基金、中國博士后科學基金、中國博士點基金、廣東省醫學科研基金、深圳市科技局重點項目等十余項科研項目。各項診療技術、質量指標及科研工作均達到國內先進水平。治療成功率位于國內領先地位。

　　科室目前開展以治療不孕不育癥相關的多種診療技術，治療范圍涵蓋了影響生殖健康的多種疑難疾病如：多囊卵巢綜合征、排卵障礙、黃體功能不全、盆腔炎癥性疾病、男性因素、免疫因素、子宮內膜異位癥、子宮肌瘤、卵巢早衰、宮腔粘連及不明原因性不孕等常見類別的不孕癥。科室擁有先進的醫療設備，精湛全面的各項技術，完成了國內首例“單精子卵胞漿顯微注射受精”試管嬰兒技術。

　　已成功開展的輔助生殖技術：宮腔內人工授精（IUI）、體外受精-胚胎移植（IVF-ET）、卵胞漿內單精子顯微注射（ICSI）、凍融胚胎移植（TET）、宮腔內配子移植（GIUT）、不成熟卵母細胞體外成熟培養（IVM）、輔助孵出、序貫囊胚培養以及卵子和胚胎的玻璃化冷凍保存、子宮內膜局部修整、微刺激周期及自然周期IVF、多胎妊娠減胎技術、胚胎輔助孵化、卵母細胞凍存、精子凍存、卵巢組織凍存，附睪穿刺取精術、睪丸活檢術、包皮環切術等等。男科新開展的手術項目：顯微睪丸取精術，輸精管吻合術，輸精管附睪吻合術、精囊探查術、顯微精索靜脈結扎術等多項技術。

　　男科實驗室開展項目：常規精子質量與形態學檢查、精子頂體酶活性定量檢測、精子膜表面抗體、精漿生化（中性α-葡糖苷酶、果糖、彈性硬蛋白酶）定量檢測、精子低滲功能滲透法檢測（HOS實驗）、精子核完整性檢測（DNA）、性交后實驗等診療技術。